Biology 3

Modelling neural network as matrix

뉴런 하나의 활성을 조사하는 방법이 존재한다-칼슘 이미징, single neuron firing 등활성화되는 뉴런을 1, 활성화되지 않는 뉴런을 0으로 표시하자. 현재 연구들은 어떤 task 또는 behavior 중 어떤 region이 활성화되고 어디서 어디로 project하는 뉴런이 활성화된다이런 결과를 보여줌, 그렇다면 어떤 behavior를 하나의 뉴런 행렬로 표시할 수 있을 것 실제 데이터로 이 행렬을 어떻게 쓸지 해보자!

Biology 2024.08.29

20240826 Neural circuit basis of placebo pain relief

placebo analgesia conditioning (PAC) assay3일 habituation, 이후 3일 conditioning, 7일째 post conditioning analgesia test2 chambers, visually distinct cueshabituation 동안 두 챔버 모두 30도, 3일째 behavior를 baseline으로 설정conditioning 동안 하나는 48도로 올림test 때는 둘 다 48도실제로 placebo analgesic effect 나타난 것과 같은 behavior. post-test day에도 유사한 behaviornocifensive behavior (pain으로 인해 나타나는 behavior-rearing, licking, jumping)를 확인..

Biology 2024.08.27

20240814 De novo design of modular and tunable protein biosensors

-심포지엄 발표를 위한 논문정리- \AbstractNaturally occuring protein switches (eg. G protein)에서 착안, peptide key가 binding하면 특정 반응을 일으키는 protein switch를 이용해 biosensor를 설계함. 이 biosensor는 modular, closed dark state와 open luminescent state를 가짐. Analyte binding과 sensor activation이 thermodynamically coupled -> target binding domain 1개 (simple)본 논문에서는 Bcl-2 (anti-apoptotic protein), IgG1 Fc domain, Her2 receptor, Bot..

Biology 2024.08.17