jaeheon shin님의 블로그

Mammal에서 female은 hormonal change, offspring으로부터의 sensory cue에 영향받아 care.Male은 care에 잘 참여 X, biparental care는 전체의 5 % 정도에서 발견 oldfield mouse (Peromyscus polionotus subgriseus)이 종은 socailly monogamous, cooperative biparental careadrenal gland가 다른 종보다 몸 크기 대비 길다는 것을 발견-> deer mouse (Peromyscus maniculatus)와 비교, 몸 크기 대비 steroid hormone producing region이 9배 이상-> unknown hormone producing cell 발견.  ol..

\생명과학 내용은 아니지만, AI와 bias를 공부하기 위해 작성함 Large language models (LLMs)는 여러 용도로 이용됨, 그러나 부적절한 답변을 할 수 있음Hofmann et al.: LLM은 사투리(어투)에 따라 racial prejudices 보인다 여러 language technology가 unjust behavior 보임.Toxicity-detection model: disability를 mention하는 benign text를 toxic 하다고 판단GPT-3: 무슬림이 언급된 인풋에 대해 violent한 text를 생성 이런 behavior는 predictable하다: LLM의 training data는 language technology development에서 배제되는언..

뉴런 하나의 활성을 조사하는 방법이 존재한다-칼슘 이미징, single neuron firing 등활성화되는 뉴런을 1, 활성화되지 않는 뉴런을 0으로 표시하자. 현재 연구들은 어떤 task 또는 behavior 중 어떤 region이 활성화되고 어디서 어디로 project하는 뉴런이 활성화된다이런 결과를 보여줌, 그렇다면 어떤 behavior를 하나의 뉴런 행렬로 표시할 수 있을 것 실제 데이터로 이 행렬을 어떻게 쓸지 해보자!

placebo analgesia conditioning (PAC) assay3일 habituation, 이후 3일 conditioning, 7일째 post conditioning analgesia test2 chambers, visually distinct cueshabituation 동안 두 챔버 모두 30도, 3일째 behavior를 baseline으로 설정conditioning 동안 하나는 48도로 올림test 때는 둘 다 48도실제로 placebo analgesic effect 나타난 것과 같은 behavior. post-test day에도 유사한 behaviornocifensive behavior (pain으로 인해 나타나는 behavior-rearing, licking, jumping)를 확인..

\연결하여 읽어볼 것:https://www.nature.com/articles/s41586-024-07816-z Placebo effect: biological effect에 대한 순수한 자체가 그 effect를 만듬Pain에 관여하는 limbic system의 neuron이 이 pain relief를 조절한다는 기존 연구 (Chen et al.)이 neuron들은 brainstem, cerebellum으로 신호 전달, 이 region들은 more-basic function 수행하기에 surprisingplacebo effect 자체의 진위는 논쟁 (질병 진행으로 그냥 서서히 낫는 것, statastical tendency)이지만 이제는 믿는 분위기pain relief에 관여하는 placebo analg..

-심포지엄 발표를 위한 논문정리- \AbstractNaturally occuring protein switches (eg. G protein)에서 착안, peptide key가 binding하면 특정 반응을 일으키는 protein switch를 이용해 biosensor를 설계함. 이 biosensor는 modular, closed dark state와 open luminescent state를 가짐. Analyte binding과 sensor activation이 thermodynamically coupled -> target binding domain 1개 (simple)본 논문에서는 Bcl-2 (anti-apoptotic protein), IgG1 Fc domain, Her2 receptor, Bot..

Dopamine transporter의 ligand binding 원리, 이를 이용한 dopamine imbalance 해결 Human dopamine transporter (DAT): presynaptic nerve terminal에 존재. Dopamine reuptake 수행, Na+ gradient와 연관Dopamine: adrenaline, noradrenaline precursor. appetite, mood, movement, reward-related behavior 영향Dopamine loss -> Parkinson's diseaseLevodopa (drug): 체내에서 dopamine으로 전환됨Dopaminergic system imbalance는 addictive behavior, AD..

Tight junction은 plasma membrane을 따라 'spread' 되는 protein condensate에 의해 형성된다 Liquid-liquid phase seperation (LLPS)으로 형성된 condensate가 PM과 contact하면 wetting이 일어남Wetting: 물방울이 퍼지듯 liquid가 퍼지는 과정 Tight junction은 epithelial/endothelial cell에서 diffusion barrier이자 selective pore로서 기능Claudin family와 같은 transmembrane protein이 cell gap을 span, fibril이 tight-junction strand 형성Zonula occludens(ZO) family와 같은 ..